Berdirinya Madarasah Ibtidaiyah Muhammadiayah 1 Babakan tidak terlepas Sebagaimana telah menjadi berita dari mulut ke mulut oleh masyarakat wilayah Kecamatan Kalimanah pada waktu tahun 60 an  bahwa desa Babakan termasuk salah satu desa yang dipandang maju agamanya diantara desa-desa di wilayah kecamatan Kalimanah pada waktu itu yang disponsori oleh Ranting Muahammadiyah Babakan.

Bersama dengan laju perkembangan Islam, beberapa tokoh agama yang selalu aktif mengisi pengajian dalam forum – forum umum pertemuan pemuda, dan lain sebagainya .Namun demikian tidak terlupakan juga untuk merintis suatu pendidikan yang disiapkan untuk sebagai pengganti atau penerus perjuangan melalui pendidikan formal.